在中古时期，当时的教会强调信仰的力量可以治愈百病，但许多教士仍然参考早期希腊罗马时代的医疗用书，种植各种药草，来为教区的民众治疗。
11世纪时，罗马帝国不断向外扩张，远征军把随身携带的药草洒遍了沿途，使得药草知识的传播更为广泛。当时人们在瘟疫等传染病爆发时，也懂得烧煮药草消毒，或者以气味驱除一些病媒。
16世纪时，就有妇女挂着装有各种花草的布袋，用来防止细菌感染。同一时期的英国人约翰杰洛引进地中海的花草植物到英国，根据自己的经验指导人们施用花草植物，其出版的《药草简史》在民间广为流传，称为英国早的药草书籍之一。
16~17世纪，中国和西方都开始比较严谨的态度来研究药草，逐渐朝着科学的方向前进。
18世纪中期，有专家宣称:"过度饮茶会伤害神经，造成颤抖、麻痹、忧郁发作等疾病"。于是，一般的乡村医生就曾建议饮用属性较温和的薄荷、鼠尾草植物或黑莓药等花草茶。
19世纪后，随着医学的发达和西药的普及。药草退而为民间所普遍使用。法国宫廷和贵族之间逐渐把花草茶当作一种休闲茶饮，以体现生活的奢华与优雅，从此饮用花草茶成了一种时尚又健康的生活标志，逐渐在欧洲流行开来。
上世纪80年代花草茶大量引进我国台湾后，其天然健康的风味也得到了人们的青睐。台湾人为了将它与一般药用茶相区别，雅称其为"花草茶"。
